MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN05

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010629	ATTA	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010629	ATTA	2	8	79	86	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010629	TGT	2	6	104	109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010629	AGGC	2	8	117	124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010629	TTGT	2	8	125	132	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010629	TAG	2	6	136	141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010629	TC	3	6	149	154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010629	A	6	6	191	196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010629	AT	4	8	214	221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010629	TA	3	6	287	292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010629	TAA	2	6	332	337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010629	AGC	2	6	367	372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010629	GA	3	6	379	384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010629	TGT	2	6	428	433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010629	CT	3	6	452	457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010629	CAG	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010629	CAA	2	6	523	528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010629	TGCT	2	8	553	560	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010629	ATG	2	6	628	633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010629	TGG	2	6	672	677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010629	GAC	2	6	693	698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010629	CGG	2	6	860	865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010629	AGTTT	2	10	952	961	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010629	AGC	2	6	992	997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010629	TTG	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010629	A	6	6	1034	1039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010629	AT	4	8	1057	1064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010629	A	6	6	1118	1123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010629	AAT	2	6	1223	1228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010629	TGGG	2	8	1240	1247	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010629	GAG	2	6	1781	1786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010629	ATT	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010629	GCA	2	6	2256	2261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010629	ACTA	2	8	2365	2372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010629	AGC	2	6	2387	2392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010629	ATCC	2	8	2415	2422	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010629	CT	3	6	2478	2483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010629	AGA	2	6	2494	2499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010629	CAA	2	6	2984	2989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010629	CCT	2	6	3549	3554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010629	TAA	2	6	3580	3585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010629	TGG	2	6	3591	3596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010629	AAT	2	6	3633	3638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010629	AAT	2	6	3641	3646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010629	TA	3	6	3648	3653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010629	CA	3	6	3709	3714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010629	AGT	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010629	TAA	2	6	3765	3770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010629	TAA	2	6	3813	3818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010629	AAAT	2	8	3832	3839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010629	ATT	2	6	3868	3873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010629	GGC	2	6	3900	3905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010629	TGGCAG	2	12	3963	3974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010629	GCT	2	6	7145	7150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010629	TTA	2	6	7202	7207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010629	CAA	2	6	7252	7257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010629	AC	3	6	7262	7267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010629	TTGC	2	8	7313	7320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010629	AGG	2	6	7357	7362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010629	T	6	6	7507	7512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010629	AAACTT	2	12	7576	7587	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010629	T	7	7	7586	7592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010629	T	6	6	7602	7607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010629	AAT	2	6	7615	7620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010629	TTA	2	6	7621	7626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010629	AT	3	6	9685	9690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010629	AAT	2	6	9730	9735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010629	ATTA	2	8	9972	9979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010629	ATTA	2	8	10230	10237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010629	ATT	2	6	10254	10259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010629	GTG	2	6	10278	10283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010629	A	6	6	10378	10383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010629	ACTT	2	8	14013	14020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010629	ATC	2	6	14044	14049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010629	CT	4	8	14081	14088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010629	GTT	2	6	14185	14190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010629	CTT	2	6	14492	14497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010629	TGAT	2	8	15878	15885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010629	GGC	2	6	15907	15912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010629	AAT	2	6	16067	16072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010629	GCT	2	6	16173	16178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010629	TAA	2	6	16186	16191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010629	GAA	2	6	16227	16232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010629	TTA	2	6	16428	16433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010629	A	6	6	16473	16478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010629	ATT	2	6	16482	16487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010629	TATT	2	8	16513	16520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010629	TAA	2	6	16544	16549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010629	GTT	2	6	16642	16647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010629	AGA	2	6	16658	16663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010629	TTTG	2	8	16670	16677	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010629	CA	3	6	16797	16802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010629	TTGA	2	8	20006	20013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010629	CCAG	2	8	20174	20181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010629	TC	3	6	20276	20281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010629	CCG	2	6	20302	20307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_010629	T	6	6	20322	20327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010629	TAC	2	6	20330	20335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010629	T	6	6	20360	20365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010629	TGA	2	6	20428	20433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010629	A	6	6	20539	20544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010629	ATG	2	6	20572	20577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010629	TC	3	6	20601	20606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010629	TGA	2	6	20661	20666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010629	TCT	2	6	20734	20739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010629	ATT	2	6	20823	20828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010629	TA	3	6	20830	20835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010629	A	7	7	20845	20851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010629	CCA	2	6	21004	21009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_010629	TTGA	2	8	21955	21962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010629	ATT	2	6	22029	22034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010629	A	6	6	22084	22089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010629	AGCCA	2	10	22148	22157	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_010629	TAG	2	6	22166	22171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010629	A	6	6	22209	22214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010629	T	6	6	22296	22301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010629	T	6	6	22451	22456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010629	TCA	2	6	22536	22541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010629	TGA	2	6	22602	22607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010629	CTT	2	6	22744	22749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010629	TGTC	2	8	22757	22764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010629	GTA	2	6	22788	22793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010629	ATA	2	6	22802	22807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010629	ATT	2	6	23458	23463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010629	TTA	2	6	23611	23616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010629	T	7	7	23702	23708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010629	T	6	6	23745	23750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010629	AAT	2	6	23779	23784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010629	T	6	6	23792	23797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010629	CTT	2	6	23802	23807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010629	AATTT	2	10	24109	24118	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010629	TTAA	2	8	24119	24126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010629	TAAT	2	8	24180	24187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010629	GTC	2	6	24217	24222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010629	GAC	2	6	24235	24240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010629	TAA	2	6	25333	25338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010629	TAA	2	6	25365	25370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010629	TTA	2	6	25377	25382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010629	TAA	2	6	26351	26356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.